Un giovane Shaggy Rogers incontra per caso un cucciolo di alano parlante, Scooby-Doo, e tra i due nasce un’amicizia indissolubile. Insieme, durante una notte di Halloween, si uniscono a Fred, Daphne e Velma, dando vita alla Mystery Inc. Anni dopo, il gruppo si trova ad affrontare la minaccia più grande: il criminale Dick Dastardly vuole liberare Cerberus, il cane spettrale a tre teste, e solo Scooby può fermarlo grazie a un destino epico che lo lega alle porte dell’oltretomba. Con l’aiuto del supereroe Blue Falcon e del suo compagno Dynomutt, la banda dovrà salvare il mondo e dimostrare che l’amicizia è la loro vera forza.